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PCR实验室设计规范

      基因扩增实验又称PCR实验,具有灵敏度高、特异性高、快捷、对样品要求低等优点,在疾病防控、检验检疫、动物健康、食品安全等公共卫生领域的应用越来越广泛。但PCR实验需要有能保证绝对安全、配置合理的实验室和非常规范的操作为前提,因此,建立一个高标准符合规范的PCR实验室,已经成为一个普遍性需求。

      现在以临床样本PCR检测实验室为例,来介绍PCR实验室的设计原则。

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1、分区设置

 

      临床基因扩增检验实验室原则上分为四个单独的工作区域:试剂贮存和准备区、标本制备区、扩增区、扩增产物分析区,如使用全自动分析仪,区域可适当合并。为避免交叉污染,进入各个工作区域必须严格遵循单一方向进行,即只能从试剂贮存和准备区→标本制备区→扩增区→扩增产物分析区。各实验区之间的试剂及样品传递应通过传递窗进行。

      在理想情况下,PCR实验室试剂准备、标本制备、扩增三个区域可设置缓冲间。

·各工作区域完全相互独立;

·各工作区域之间无条件设置缓冲间;

·按各区域要求设置实验室压力;

·若各区紧密相连,需安装物品传递舱;

·人流、物流单一方向流动;

·各区仪器设备、清洁用具明确标记,不得混用;

·各区使用不同的实验服,实验服不得带出

·工作结束后立即清洁

2、各区功能及设置

 

2.1 试剂贮存和准备区

区域功能:

      所有试剂的配制与分装,主反应混合液的制备,试剂原材料和配制试剂的贮存。试剂和用于标本制作的材料应直接运送至该区,不得经过其他区域。

            本区对与气流压力的控制,没有严格要求。

仪器设备:

超净工作台                                  高速离心机                                电子天平 

2~8℃和-20℃以下冰箱               混匀器                                      微量加样器(覆盖0.2-1000µl)

可移动紫外灯(近工作台面)       专用工作服和工作鞋                   专用办公用品

消耗品(一次性手套、耐高压处理的离心管和加样器吸头)

2.2 标本制备区

区域功能:

      临床标本的保存、核酸(RNA、DNA)提取、贮存及其加入至扩增反应管和测定RNA时cDNA的合成。 临床样本应符合生物安全二级实验室防护设备、个人防护和操作规范的要求。具有潜在传染危险性的材料:必须在生物安全柜内开盖,并有明确的样本处理和灭活程序。

      本区的压力梯度要求为:相对于邻近区域为正压,以避免从邻近区进入本区的气溶胶污染。

仪器设备:

2-8℃冰箱、-20℃或-80℃冰箱        高速离心机                         混匀器

水浴箱或加热模块                            微量加样器                         可移动紫外灯

生物安全柜                                      专用工作服和工作鞋            专用办公用品

超声波水浴仪                                   消耗品(一次性手套、耐高压处理的离心管和加样器吸头)

2.3 扩增区

区域功能:

      该区域主要进行的操作为DNA或cDNA扩增。此外,已制备的DNA模板和合成的cDNA(来自样本制备区)的加入和主反应混合液(来自试剂贮存和制备区)制备成反应混合液等也可在本区内进行。在巢式PCR测定中,通常在第一轮扩增后必须打开反应管,因此巢式扩增有较高的污染危险性,第二次加样必须在本区内进行。

      本区的压力梯度要求为:相对于邻近区域为负压,以避免气溶胶从本区漏出。个别操作如加样等应在超净台内进行。

仪器设备:

荧光定量PCR仪                           PCR扩增仪                          超净工作台(生物安全柜)

低温、冷藏冰箱                           微量加样器                         可移动紫外灯

专用工作服和工作鞋                    专用办公用品                       消耗品:一次性手套、耐高压处理的离心管和加样器吸头

2.4 扩增产物分析区

区域功能:

      该区域主要进行的操作为扩增片段的测定。如使用全自动封闭分析仪器检测,此区域可不设。

      本区的压力梯度的要求为:相对于邻近区域为负压,以避免扩增产物从本区扩散至其它区域。

仪器设备:

      视检验方法不同而定。基本仪器设备如下:

微量加样器                                  微波炉                                 电泳仪

凝胶成像系统                               可移动紫外灯                      专用工作服和工作鞋

专用办公用品                               消耗品(一次性手套、加样器吸头)

3、工作人员操作要求

 

实验操作中                                                                                  实验结束后

一次性手套和帽子                                                                        立即进行清洁

正确使用加样器,避免产生气溶胶污染                                          实验室台面、超净台10%次氯酸钠溶液擦拭

实验材料散落或PCR产物外溅时,立即清洁处理并做记录                实验室空间定期紫外照射

                                                                                                   实验室和设备的使用必须有日常记录

4、试剂

 

等级                                   实验用水                                   试剂配置                                      质量控制

不含DNA和DNase             一级水                                    大体积配置,小体积分装。             关键试剂质量检测

的分析纯和生化试剂                                                          标注名称、浓度、配置者、

                                                                                         保存条件、失效时间

5、防止污染

 

      PCR实验室设计的核心问题是如何避免污染。由于一旦发生污染,实验就必须停止,直到找到污染源为止,而且实验结果必须作废,需重新进行实验。所以发生污染后再围绕实验室来寻找污染源不但耗时而且繁琐,浪费人力物力。因此要避免污染,首先应是预防,而不是排除。

      严格分区:工作服;实验用具;实验记录本

      样品管理:包装完好;明确标识;避免交叉污染

      扩增产物:PCR反应液加UDG酶;dUTP代替dTTP

      RNase:玻璃器皿和溶液经DEPC处理;实验起始阶段使用RNase抑制剂;实验操作在冰浴中进行。

      污染后处理:环境污染源检测;材料散落、产物外溅立即清洁并记录

6、安全防护

 

      放射线:依据GB11930-2010操作非密封源的辐射防护

      紫外线:防护目镜和面罩

      溴化乙锭:一次性腈类手套、固定区域与容器

      细菌培养物:培养物及其平皿121℃、30min消毒后丢弃

7、废弃物处理

 

      吸头使用过必须放入专门的消毒容器(含10%的次氯酸钠溶液)内浸泡不少于24h污染PCR产物必须放至1 mol/L HCl中浸泡后再放到垃圾袋中按程序处理,如焚烧

      废液:含有PCR产物的任何废液必须收集至1 mol/L HCl中,浸泡时间不少于6h,并且不能在实验室内倾倒,而应当至远离PCR实验室的地方弃掉

      含EB含有EB或经过EB浸泡的琼脂糖凝胶、电泳缓冲液净化处理

      阳性样品:GB/T 19495.1-2004

      阳性质粒:1mol/LHCl浸泡不少于6h

 

  

  

  

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